研究成果
20世纪70年代末，针对中国经济发展中存在的问题，财政部科研所经过调查、研究，力主国民经济调整的观点。向财政部党组和国家领导层提交了以“调整”为主的研究报告，对国家最高层制定“调整、改革、整顿、提高”的八字方针产生了重大作用。同时，完成了收集整理革命根据地财政史料这一工程，出版财政经济史资料25套，计4200万字；完成根据地财政史稿14册，约500万字。
在市场经济体制确立过程中，财政部科研所围绕建立社会主义市场经济体制的总思路，针对中国经济转型和发展中面临的重大问题开展了一系列研究。1992年至2000年，向财政部和中央领导上报的内部《研究报告》近300期，《内报》近100期，其中有不少为国务院、财政部领导和有关部门所重视和采纳，为建立和完善社会主义市场经济体系和财政理论体系及支持科学决策作出了贡献。
21世纪后，财政部科研所对公共政策理论、分税制财政体制、财政风险、三农问题、构建节约型社会的公共政策、经济全球化、中国特色社会主义的焦点、热点、难点问题进行了研究。2001至2005年，上报内部《研究报告》256期，《科研内报》72期，其中不少建议为财政部领导和国务院领导重视和采用，得到国家和中央主要领导的签批，并推动了财政政策和理论研究的创新和发展。
教学建设
据2017年1月财科院官网显示，财科院博士研究生指导教师52 名，硕士研究生指导教师179 名，在站博士后186人，在读研究生规模约为800余人。
截至2015年6月，财科院共授学位总数为3292 个，其中博士学位665个、硕士学位2627个。
合作交流
改革开放后，财科院科研人员多次到美国、英国、法国、德国、意大利、日本、韩国、俄罗斯、加拿大、澳大利亚、巴西、以色列、南非、埃及、印度、泰国、新加坡等国家考察、学习、参加研讨会，进行合作课题研究；派出多批中青年科研骨干赴国外培训，学习外国财政理论和实际工作经验；多次邀请和接待世界各国的财经专家、学者来华访问，进行学术交流。
